Зеленоборская санаторная школа-интернат находится в городском поселении Зеленоборский Кандалакшского района Мурманской области. Школа-интернат имеет удобное расположение:
- школа расположена в сосновом бору в 300 метрах от озера Ковдозеро,
- в 4 км находится выезд на федеральную автомобильную трассу Мурманск - Санкт-Петербург,
- в 40 км находится районный центр город Кандалакша.